MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-6

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011411	T	6	6	75	80	0 %	100 %	0 %	0 %	209916826
2	NC_011411	ATTC	2	8	173	180	25 %	50 %	0 %	25 %	209916826
3	NC_011411	GAG	2	6	277	282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916826
4	NC_011411	AT	3	6	410	415	50 %	50 %	0 %	0 %	209916826
5	NC_011411	AAG	2	6	426	431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916826
6	NC_011411	CTC	2	6	454	459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916826
7	NC_011411	CAG	2	6	460	465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916826
8	NC_011411	TAT	2	6	486	491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916826
9	NC_011411	GAT	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916826
10	NC_011411	ATT	2	6	564	569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916826
11	NC_011411	A	7	7	595	601	100 %	0 %	0 %	0 %	209916826
12	NC_011411	ACAA	2	8	677	684	75 %	0 %	0 %	25 %	209916826
13	NC_011411	T	8	8	740	747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011411	TAG	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011411	A	6	6	811	816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011411	T	6	6	826	831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011411	AAAAC	2	10	841	850	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011411	TG	4	8	864	871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011411	CTT	2	6	872	877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011411	GAA	2	6	903	908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011411	CGA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011411	AAACA	2	10	933	942	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011411	GT	3	6	997	1002	0 %	50 %	50 %	0 %	209916827
24	NC_011411	CGC	2	6	1019	1024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916827
25	NC_011411	AGCG	2	8	1052	1059	25 %	0 %	50 %	25 %	209916827
26	NC_011411	GAT	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
27	NC_011411	GT	3	6	1086	1091	0 %	50 %	50 %	0 %	209916827
28	NC_011411	GCA	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916827
29	NC_011411	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
30	NC_011411	GCTG	2	8	1242	1249	0 %	25 %	50 %	25 %	209916827
31	NC_011411	ACA	2	6	1301	1306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916827
32	NC_011411	AG	3	6	1313	1318	50 %	0 %	50 %	0 %	209916827
33	NC_011411	AAGCTG	2	12	1342	1353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209916827
34	NC_011411	CCTT	2	8	1425	1432	0 %	50 %	0 %	50 %	209916827
35	NC_011411	ATGGC	2	10	1443	1452	20 %	20 %	40 %	20 %	209916827
36	NC_011411	TGGC	3	12	1449	1460	0 %	25 %	50 %	25 %	209916827
37	NC_011411	TCT	2	6	1463	1468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916827
38	NC_011411	GTG	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916827
39	NC_011411	TCG	2	6	1852	1857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916827
40	NC_011411	CG	3	6	1861	1866	0 %	0 %	50 %	50 %	209916827
41	NC_011411	TCC	2	6	1880	1885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916827
42	NC_011411	C	6	6	1953	1958	0 %	0 %	0 %	100 %	209916827
43	NC_011411	CTG	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916827
44	NC_011411	GCC	2	6	2096	2101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916827
45	NC_011411	GAT	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
46	NC_011411	T	6	6	2149	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	209916827
47	NC_011411	GCA	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916827
48	NC_011411	TTCG	2	8	2184	2191	0 %	50 %	25 %	25 %	209916827
49	NC_011411	CAT	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916827
50	NC_011411	GAT	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
51	NC_011411	GT	3	6	2313	2318	0 %	50 %	50 %	0 %	209916827
52	NC_011411	CGG	2	6	2366	2371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916827
53	NC_011411	CGC	2	6	2457	2462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916827
54	NC_011411	ATG	2	6	2616	2621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
55	NC_011411	CAG	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916827
56	NC_011411	ATG	2	6	2708	2713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
57	NC_011411	CTGA	2	8	2770	2777	25 %	25 %	25 %	25 %	209916827
58	NC_011411	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916827
59	NC_011411	CAGG	2	8	2933	2940	25 %	0 %	50 %	25 %	209916827
60	NC_011411	AGTC	2	8	3001	3008	25 %	25 %	25 %	25 %	209916827
61	NC_011411	TCA	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916827
62	NC_011411	GCA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916827
63	NC_011411	GAT	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
64	NC_011411	GAT	2	6	3102	3107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916827
65	NC_011411	TTTC	2	8	3143	3150	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011411	CA	3	6	3165	3170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011411	CAT	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916828
68	NC_011411	AGA	2	6	3315	3320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916828
69	NC_011411	TGCTGA	2	12	3322	3333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209916828
70	NC_011411	GCA	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916828
71	NC_011411	GGA	2	6	3430	3435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916828
72	NC_011411	TAC	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916828
73	NC_011411	CGC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011411	AGCG	2	8	3591	3598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011411	T	6	6	3741	3746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011411	T	6	6	3768	3773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011411	TCG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011411	AAGGTA	2	12	3915	3926	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011411	GGA	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011411	TAAAA	2	10	4008	4017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011411	GGGA	2	8	4069	4076	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.